Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms