Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP17L20D6RJB6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP17L20D6RJB6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms