Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms