Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms