Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms