Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms