Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC180Q9P1Z9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms