Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTLNQ9NXG0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms