Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1142.9 ms