Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM30AQ9NV96 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms