Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms