Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PARD6AQ9NPB6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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