Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRHQ9HD43 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms