Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZMAT3Q9HA38 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms