Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms