Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms