Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms