Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms