Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms