Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMT61BQ9BVS5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms