Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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