Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms