Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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