Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms