Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCAMP4Q969E2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms