Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms