Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM41Q8WV44 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms