Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L2Q8NAA4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms