Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms