Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR49Q8IV35 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms