Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HAPLN4Q86UW8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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