Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATG4DQ86TL0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATG4DQ86TL0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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