Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRAMD4Q6IC98 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRAMD4Q6IC98 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms