Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms