Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SDK2Q58EX2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms