Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FAAH2-201ENST00000374900 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL1-201ENST00000276935 2906 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms