Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDCCQ504Y2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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