Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms