Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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