Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms