Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPROQ16827 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPROQ16827 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPROQ16827 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPROQ16827 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPROQ16827 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPROQ16827 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPROQ16827 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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