Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NDUFA9Q16795 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms