Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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