Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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