Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RBBP7Q16576 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RBBP7Q16576 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RBBP7Q16576 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RBBP7Q16576 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RBBP7Q16576 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RBBP7Q16576 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RBBP7Q16576 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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