Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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