Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms