Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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