Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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