Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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